Emellett széles spektrumú, magas színvonalú diagnosztikai szolgáltatásokkal áll a betegek rendelkezésére (két MR készülék (3T, 1, 5T), két CT készülék (256- és 64 szeletes), ultrahang, RTG, angiographia, haemodinamikai laboratórium, EKG, Holter-monitorizálás, EEG, izotópdiagnosztika, laboratórium, patológia, citológia, molekuláris patológia, haemostaseológia, immunhaematológia, transzplantációs immunológia és genetikai diagnosztika, stb. Az oktatási és tudományos munkát a kórház kezdettől fontos feladatának tartotta. Kórházunk képzéssel, szakképzéssel és továbbképzéssel kapcsolatos, valamint az oktatási és az alkalmazott kutatási tevékenysége hazai kórházak viszonylatában speciális helyzetéből adódik. A régióban orvosegyetem nincs, de gyakorlóhelye a medikusképzésnek, háziorvosi képzés- és továbbképzésnek, valamint a mind nagyobb jelentőséggel bíró ápoló-, védőnő- és szülésznőképzésnek. Ezen kívül a kórházban működik a szakdolgozók továbbképzését, az ápoláskutatást segítő Regionális Oktatási Decentrum.
2007. február 15. -én tulajdonosi döntés következtében kórházunk egyesült a szentgotthárdi Vas Megyei Rehabilitációs Kórház és Gyógyfürdővel. A kórház 2007. október 01. -től gazdasági társaságként működött 2013. 04. 01. -ig, a társaság neve Vas Megyei Markusovszky Kórház, Egyetemi Oktatókórház Nonprofit Zártkörű Részvénytársaság volt. Majd 2013. -én megtörtént az állami tulajdonba vétel és jelenleg is költségvetési intézményként működünk. Közben folytatódott az integráció, 2013. 15. -án egyesültünk a körmendi Batthyány-Strattman László Kórházzal, majd 2017. január 01. -én a celldömölki Egyesített Kemenesaljai Kórházzal, kialakítva így két új városi telephelyet. A Markusovszky Egyetemi Oktatókórház jelenleg 952 aktív-, 559 krónikus-, összesen 1. 666 ágyon, azon belül 34 fekvőbeteg osztályon látja el betegeit. A fekvőbeteg osztályok szívsebészeti, transzplantációs és égési osztály kivételével a hazai orvosi ellátás teljes spektrumát nyújtják. Ellátási területe elsősorban Vas megye, 254 ezer fő lakossal, de számos szakmában rendelkezik több megyére, ill. régiós ellátásra vonatkozó területtel (600 ezer – 1.